
大鹏新区红树林群落特征和物种多样性研究
罗林;林琳;李宇惠;夏增强;马钰琦;王发国;以深圳大鹏新区的坝光红树林、东涌红树林和鹿咀红树林为研究对象,采用样方调查和冗余分析(Redundancy Analysis,RDA)方法,探究红树林群落的物种组成、群落结构和物种多样性.结果显示,这3个区域的红树林群落共计包含182种植物,分属于65科160属.红树林的物种丰富度较高,但不同区域之间存在显著的物种组成差异,且这3个红树林群落之间的物种相似性极低,群落总丰富度主要受灌木层物种的影响.其中坝光银叶树群落的物种多样性指数(如Margalef丰富度指数、Pielou均匀度指数、Shannon-Wiener多样性指数和Simpson多样性指数)均高于其他2个乔木群落.研究还通过对坡度、坡向、海拔、树高、胸径、灌木高和草本高等多个指标的量化来分析群落特征.结果显示,海拔是影响红树林群落分布的最重要环境因素.受近年来旅游业的盛行影响,人类活动和外来物种入侵对该区域的物种多样性威胁变大,建议进一步加强对大鹏新区红树林群落的保育与监测.
基于非靶向代谢组学分析不同产地白芍的代谢产物
陈荣珠;李珍;杜迎刚;以安徽亳州、浙江磐安、四川中江和宁夏海原4个产地白芍(Paeonia lactiflora Pall.)为研究对象,利用非靶向代谢组学研究其代谢产物的差异.通过主成分分析、偏最小二乘法分析模型和热图分析等方法,分析4个产地白芍中代谢产物的差异.结果共鉴定出21类1 423个化合物,主要为黄酮类(212个)、氨基酸及其衍生物(209个)、脂质(136个)等成分,筛选出112个差异代谢物,差异代谢物主要为氨基酸及其衍生物、黄酮类、糖类及其衍生物、有机酸及其衍生物、脂质等.经KEGG通路分析,代谢物主要分布在15条代谢途径中,代谢物数量富集最多的前3条通路分别是全局和总览图、氨基酸代谢和其他次级代谢物的生物合成.经HMDB通路分析,差异代谢物主要分布在12条代谢途径中,差异代谢物数量富集最多的前3条通路分别为有机物及其衍生物、苯丙素及聚酮化合物、脂质.研究结果为解析产地对白芍代谢产物的影响提供了理论依据,也为白芍的推广种植及优质种质资源的选育提供理论基础.
香蕉穿孔线虫甘蔗种群形态和分子特征记述
王慧中;杨思华;谢辉;徐春玲;香蕉穿孔线虫[Radopholus similis(Cobb,1893)Thorne,1949]是一种迁移性内寄生植物病原线虫,也是我国禁止进境的重要检疫性植物线虫.本研究利用形态学和分子生物学相结合的手段,对在甘蔗上发现的一种群进行了系统的描述.该种群主要形态特征为:雌虫体长656.1(516.7-730.1)μm,头环纹3个,侧区4条侧线且网格化,中带略窄于两侧,侧唇瓣延伸至第三头环纹,受精囊近圆形或椭圆形,内有短杆状精子,尾部透明尾长10.6(5.9-22.4)μm,尾端无环纹;雄虫体长587.9(533.4-668.2)μm,口针与食道腺略退化,泄殖腔前唇有3-8个生殖乳突,交合伞延伸至近尾端.获得该种群的核糖体DNA的ITS、28S D2-D3扩展区和18S区间序列,并分别基于其相似性序列和穿孔属线虫的相关序列构建了系统发育树,结合形态特征将该种群记述为香蕉穿孔线虫.研究结果丰富了香蕉穿孔线虫不同寄主种群的形态和分子特征信息,为香蕉穿孔线虫的检测和防控提供了科学依据.
深圳观叶植物根际3种植物寄生性线虫的记述
李绍钦;陈永忠;肖兰苑;温丽萍;陈超;徐春玲;2023年6-8月,在深圳东部的龙岗、坪山和大鹏新区的花卉园艺场进行了观叶植物寄生线虫为害的调查.先后对天南星科(Araceae)、棕榈科(Palmae)、竹芋科(Marantaceae)和蕉科(Musaceae)等超过1 700盆花卉进行了调查和检测,并采集了79份根和根际土壤样品.采用改良贝曼漏斗法对这些样品进行了分离,并进行了植物寄生线虫的种类鉴定.研究结果显示,短体属(Pratylenchus Filipjev,1936)、针属(Paratylenchus Micoletzky,1922)和螺旋属(Helicotylenchus Steiner,1945)线虫在相应的寄主植物根际土壤中大量存在,是绝对优势种,占相应样品中线虫数量的比例超过70%.通过形态测定和描述,并与文献记述进行比较,结合核糖体RNA内转录间隔区分子鉴定特征及生物信息学分析,鉴定的这3种线虫分别为咖啡短体线虫(Pratylenchus coffeae)、微小针属线虫(Paratylenhus minutus)和双宫螺旋线虫(H. dihystera).这些研究结果为今后观叶植物的病害检测和防治提供了重要的科学依据.
棘胸蛙线粒体全基因组及系统进化分析
郜梓涵;胡泽华;蔡林豪;刘木金;肖晗;梁日深;棘胸蛙(Quasipaa spinosa)是分布于中国南部的特色蛙种.本研究测定了采自于广东清远的棘胸蛙线粒体全基因组,针对其线粒体基因组结构特征进行分析,并基于线粒体基因组序列研究了叉舌蛙科分子系统进化关系.结果表明,棘胸蛙线粒体基因组全长为17 996 bp,包含13个蛋白质编码基因、23个tRNAs、2个rRNAs和1个非编码控制区,其基因组中存在2个连续重复的tRNA-Met基因.碱基组成为:A(29.2%)、G(14.2%)、T(30.2%)和C(26.4%),存在明显AT偏倚.基于12种蛋白编码基因构建的分子系统进化树显示,棘胸蛙位于棘胸蛙属内部,并与小棘蛙(Quasipaa exilispinosa)亲缘关系较近.对于棘胸蛙属在叉舌蛙科中的地位,该属与倭蛙属(Nanorana)聚为姐妹群,大头蛙属(Limnonectes)位于其后.该结果为棘胸蛙分子鉴定与系统进化研究提供分子水平信息.